洋上卒業式は、望星丸の後部甲板に紅白の幕が飾られ、全員正装のうえ、厳かに挙行されます。３月卒業予定の研修学生と航海工学科の乗船実習生に船長から学位記が授与されます。洋上卒業式後には、「卒業生を送る会」が開催され、研修学生の趣向を凝らした、さまざまな企画で卒業を祝います。